Atenção o conteudo a seguir tem SPOILER
Madoka Kaname
Madoka Kaname é uma garota normal que não tem nenhum talento sobrenatural,mas ai sua vida muda logo apos de conhecer Homura e Kyubey. Ela começa a ficar indecisa de ser uma Puella Magi ou não, logo apos de ver sua amiga Mami morrer,embora ela continua acompanhando Sayaka na caça as bruxas.
Akemi Homura
Uma Puella Magi que aparece no sonho de Madoka Kaname e depois se transfere para sua escola,ela é um pouco estranha por quê parece conhecer Madoka já á algum tempo.Ela tenta impedir que as garotas se transformem em Puellae Magi.Ela era uma garota tímida e extrovertida que virou amiga de Madoka,cujo o desejo fosse voltar ao tempo para salvar a amiga de uma dolorosa morte.
Sayaka Miki
Como uma Puella Magi Sayaka ataca usando espadas,podendo produzir um numero infinito dela,como também possui um fator de cura elevado por conta de seu pedido ser de cura.Ela fica bastante abalada após descobrir sobre alguns segredos da "Soul Gem",então descobre que sua amiga que sua amiga também gosta de Kyousuke e pretende confessar seus sentimentos a ele fazendo Sayaka entrar na depressão e desespero.
Mami Tomoe
Uma garota um ano mais velha que,é uma Puella Magi veterana.Mami usa como armas de rifles, que podem ser usadas como cassetetes ou como armas de fogo normais, apesar de os rifles possuírem apenas uma bala cada, ela pode produzir um artesanal infinito.
Kyubey
Um extra-terrestre que transforma garotas em Puellae Magi.Kyubey não mostra expressoes em seu rosto e não compreende os sentimentos das meninas. Ele sempre escolhe adolescentes para estudar o seu humor.Ao formar um contato com as Puellae Magi ele extrai suas almas para uma Soul Gem (ou joia da alma),Assim caso a Puellae Magi tenha seu corpo destruído em alguma batalha ele possa criar outro.
Kyoko Sakura
Uma Puella Magi egoísta e arrogante que aparece após a morte de Mami para reclamar o território da cidade para caçar às bruxas como sendo dela. Kyoko usa como arma uma lança com uma lâmina na ponta que pode se transformar em uma espécie de corrente. Ela sempre está com algum tipo de comida na boca e odeia quando pessoas disperdiçam comida. É revelado que o pai dela era um padre que resolveu pregar ensinamentos não ortodoxos, fazendo-o ser excomungado da igreja e tendo sua igreja fechada. Kyoko e sua família então viveram na pobreza sem ter o que comer até que Kyoko desejou que as pessoas ouvissem o que seu pai dizia e a igreja se encheu de fiéis, mas quando o pai de Kyoko descobriu que as pessoas estavam indo a sua igreja por causa de um desejo e não por fé, enlouqueceu e matou toda a família (com exceção de Kyoko) e se suicidou, fato que fez Kyoko decidir nunca mais usar mágica para qualquer um senão ela mesma.
